FUJIFILM GFX 50S hỗ trợ quay phim Full HD (1920×1080, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 36Mbps) và phim HD (1280×720, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 18Mbps). Các hiệu ứng giả lập phim có thể áp dụng vào trong phim, như ACROS cho phim đơn sắc chất lượng cực cao hay CLASSIC CHROME cho hiệu ứng của các loại phim tài liệu.