FUJIFILM GFX 50R supporta registrazioni video Full HD (1920×1080, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 36Mbps) e registrazioni video HD (1280×720, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 18Mbps). Gli effetti di simulazione pellicola, come ACROS per scatti monocromatici di altissima qualità e CLASSIC CHROME per un look a tema documentario, possono essere applicati anche ai video.