Le FUJIFILM GFX 50S permet les enregistrements vidéo Full HD (1920×1080, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 36Mbps) et HD (1280×720, 29.97p / 25p / 24p / 23.98p, 18Mbps). Des effets de simulation de film, tels que ACROS pour le monochrome, de très haute qualité, et CLASSIC CHROME pour un aspect de photo documentaire, peuvent également être appliqués à la vidéo.